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学术研究写作指导

利用Endnote查找实验方法相关文献的思路
2015-03-14 12:00:00
文章摘要:利用Endnote查找实验方法相关文献的思路

  在查找文献的时候,如何知道哪些是需要的文献,是整个过程里最重要的环节。其中,个人对研究领域的掌握和信息检索的经验无疑是决定性的因素。很多时候,收到研究生用户索取全文的请求,看不出其理由,一旦未得到满足,也极容易放弃。利用Endnote查找实验方法相关文献的思路

  所以,在决定做什么、怎么做的时候,还是努力找一些理由嘛。

  本帖提到的查找实验方法相关文献的思路,也是在解答研究生的问题时总结,希望能起到抛砖引玉的作用。

  用户的问题:如何查找桃子有机酸研究里,与HPLC相关的文献?

  直接采用peach organic acid加上HPLC检索,结果极少,原因在于方法等相关的信息,出现在文献题录信息(包括摘要)里的机会很小,而对文献进行检索又主要是基于题录信息。

  我的检索思路,首先还是搜集peach organic acid相关的文献。

  为了扩大信息源,检索了Web Of Science(SCI)和BIOSYS Previews两个文摘库。

  WOS的检索式尽量简化,在高级检索中采用主题检索(只为了演示,因此就不加桃的学名了):

  TS=(peach and organic acid*)

  为了下一步的检索分析,把检索结果导入到endnote,嗯,我们又提到这玩意了。

  然后进到Web Of Knowledge平台上另一个数据库BIOSYS Previews里,采用同样的方式检索,将结果导入到endnote。由于BP数据库收录的生命科学出版物更多,因此可以作为SCI信息源的补充。

  此外,BP数据库还提供了相对准确的分类检索功能,对收录的文献进行了研究对象、研究主题等字段的标引。在本例中,可以选择“分类数据(Taxonomic Data)”字段,定位到Rosaceae(蔷薇科),将文献检索范围扩大。这里演示不考虑扩大范围。

  到这步,我们只是进行文献题录信息的收集。PubMed也是适合进行下一步操作的信息源。利用Endnote查找实验方法相关文献的思路

  接下来,我们就要充分利用endnote的各种功能,对搜集的文献信息进行筛选,找出跟HPLC有关的目的文献。

  endnote提供了对本地library里文献极强的检索功能,其中最厉害的选项被莫名其妙的藏了起来。在endnote本地检索框里点击切换字段,滑动模块往上拉(而不是往下!),会看到“Any Field”和“Any Field + PDF with Notes”两个选项。其中后一个选项能够直接检索附加到本地library里的pdf的文中内容!而X7版更是将检索范围扩大到了pdf的笔记标注,方便为重要的文献进行标记。

  到这里,思路就很清楚了。我们利用endnote管理来自多方的文献题录,进行统一的检索。我们可以先建一个智能分组(smart group),在“Any Field”字段里检索“HPLC”,即不包含pdf的题录信息(事实上目前我们也没有下载pdf):

  得到题录信息里提到HPLC的相关论文分组,这部分论文显然是需要重点阅览:

  下一步,我们检索的目标就是pdf的全文。此时需要祭起邪恶的批量下载全文大法。

  对于包含了关键信息的文献题录(主要是DOI字段),endnote可以联机批量查找下载对应的pdf全文,并直接保存到本地library。这个方法过于邪恶,很容易被心智不够成熟的弟弟妹妹滥用,导致本单位数据库下载量暴增,下个年度,数据商就有了足够的数据来支持涨价 。

  所以请务必在检索范围已经足够凝练的时候,再发此大招。

  操作方法是,在endnote里选中需要的文献(单选、或者按住ctrl多选,或者ctrl+a全选),点击鼠标右键,点Find Full Texts,按提示操作即可。

  以100篇文献为例,使用该功能下载到77篇pdf(下载成功率与所在单位访问数据库的权限有关)。

  再新建智能分组,在“Any Field + PDF with Notes”里检索“HPLC”,100篇里得到37个结果,比单纯检索文献题录信息,增加了2倍:

  大功告成。整个操作对投入的时间精力要求极低,并且直接为下一步研究积累了初步的文献,一举多得。利用Endnote查找实验方法相关文献的思路


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